El museu està organitzat en àrees i cadascuna complix unes funcions determinades. En relació amb els fons museogràfics, es troben les àrees de conservació i restauració (Laboratori de restauració del museu), de documentació, d’investigació, d'educació i acció cultural i de comunicació. La Biblioteca del museu s'encarrega de custodiar, catalogar, incrementar i difondre els fons bibliogràfics, també els fons antics.