El museo cuenta con un programa de exposiciones temporales, con el objetivo principal de complementar el discurso del museo mediante otras visiones y recorridos. En estas muestras pretendemos mostrar tanto fondos propios, no expuestos de forma permanente, como piezas de otros museos o colecciones, potenciando al tiempo el diálogo cultural con otras instituciones afines a la especificidad del museo. Para ello contamos con tres espacios de exposiciones temporales: uno en la planta alta a la vuelta de la sala llamada del Apostolado, y dos en la planta baja: la sala de la biblioteca o de la pieza invitada, enfrente de San Bernardino, y la sala polivalente a la salida del museo
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Tristán. Entre lo divino y lo humano
En el marco de la conmemoración del cuarto centenario de la muerte de Luis Tristán en 2024, el Museo del Greco presenta la exposición «Tristán. Entre lo divino y lo humano». Un entorno de excepción desde el cual acercarse a la obra del pintor y al vibrante contexto artístico en el que se desarrolla.