De acuerdo con el reglamento del Consejo de Cooperación, a lo largo de estos años se han abordado diferentes líneas de actuación respecto a procesos y materias de carácter transversal en los diferentes sistemas y subsistemas de archivos, y que se han materializado en la creación de grupos de trabajo ad hoc.
En este sentido, se han planteado varios Grupos de Trabajo sobre distintas temáticas y retos comunes, como son: