En el desarrollo de la Guerra Civil española, se creó en la administración franquista una Sección de Servicios Especiales con la finalidad de centralizar todo el material documental y bibliográfico recogido en las diferentes logias que fueron clausuradas e incautadas. La sección se creó en abril de 1937, dependiendo directamente de la Secretaría Particular y Militar de Franco y acabaría formando parte de la Delegación Nacional de Servicios Documentales que se creó en 1944.
Esta sección se ocupó de recoger archivos y publicaciones procedentes de la Masonería, pero también de otras doctrinas y movimientos filosóficos muy diversos entre los que se encontraban la teosofía, el naturismo, el ocultismo, el espiritismo, el rotarismo…
La Biblioteca del Centro Documental de la Memoria Histórica ha heredado estas colecciones, con la misión de preservarlas, fomentar su conocimiento y ponerlas al servicio de los ciudadanos y los investigadores.