El Director/a General es nombrado y separado por Real Decreto, acordado por el Consejo de Ministros a propuesta del Ministro de Cultura: Dª María Paz Santa-Cecilia Aristu. Ver perfil y trayectoria
De la Dirección General dependen con nivel orgánico de Subdirección General:
Secretaría General. Titular: Benjamín Marco Valero
Subdirección General de Música y Danza. Titular: Ana Belén Faus Guijarro
Subdirección General de Teatro. Titular: Miriam Gómez Martínez
Subdirección General de Personal. Titular: Marina Albinyana Álvarez
Subdirección General Económico-Administrativa. Titular: María Leticia González Verdugo
Además, se adscriben al INAEM los siguientes centros de producción, exhibición, documentación y formación artística:
Auditorio Nacional de Música (ANM). Gerente: Javier Moreno Artés
Centro Nacional de Difusión Musical (CNDM). Director: Francisco J. Lorenzo Fraile de Manterola
Joven Orquesta Nacional de España (JONDE). Directora: Ana Comesaña Kotliarskaya
Orquesta y Coro Nacionales de España (OCNE).
Director ONE: David Afkham
Director CNE: Miguel A. García Cañamero
Ballet Nacional de España (BNE). Director: Rubén Olmo Leal
Compañía Nacional de Danza (CND). Directora: Muriel Romero Abellán
Teatro de la Zarzuela (TZ). Directora: Isabel María Benavente Ferreras
Centro Dramático Nacional (CDN). Director: Alfredo Sanzol Sanz
Compañía Nacional de Teatro Clásico (CNTC). Directora: Laila Ripoll
Centro de Tecnología del Espectáculo (CTE). Director: Carlos Martínez Andreu
Museo Nacional de Artes Escénicas (MNAE). Directora: Beatriz Patiño Lara
Centro de Documentación de las Artes Escénicas y de la Música (CDAEM). Directora: Marina Bollaín Pérez-Mínguez
Castillo-Palacio de Magalia (CPM). Director: Antonio Cervera Aragón